《合金弹头5》是SNK发行的横版动作射击类游戏，于2003年11月14日发售，是《合金弹头》系列的第六部作品。

故事背景：在与摩登军队的战斗结束后，新的强敌出现，并夺走了“METAL SLUG”的机密磁盘，马尔克、塔马、菲奥、笠本四位正规军士兵，将进行下一次严酷的任务考验。（次世代METAL SLUG开发中的研究所遭到不明敌人的袭击，记录了“METAL SLUG”的机密的磁盘被强行夺走。马尔克和塔马接到了夺回磁盘的命令后，前往追踪其去向。另一方面，正在调查盗掘遗迹的武装组织“托勒密军（PTOLEMAIC ARMY）”的菲奥和笠本，成功地追踪到古代遗迹“火之回廊”。虽然尝试突入遗迹，但是因原居民及巨型“METAL SLUG”阻挡而无法前进。由此事件中，判断出抢夺“METAL SLUG”机密的敌人就是托勒密军。正规军为了夺回机密和消灭组织，决定派遣由PF队及少数精锐部队实行追击“火之回廊”的作战。)

在《合金弹头5》中，反叛军、唐纳德·摩登和艾伦·奥尼尔等传统系列的反派均未登场，改而与由蒙面的恐怖分子、特种部队等组成的托勒密军进行作战。该作取消了大部分的形态转变，仅保留“肥胖形态”，并且其仅在任务1中可以使用；删除了喷火枪及《合金弹头4》中的勋章系统。新增“滑铲”动作，通过蹲下按跳跃键即可执行。

在游戏的各阶段都存在过场动画，以此来提供剧情方面的情节展示。